MyMBGD/データ解析

MyMBGD

ゲノム登録方法†

1. MyMBGDのトップページの[Enter Your Data]をクリックします。
2. [Create New Genome]をクリックします。
3. ゲノムの情報を入力し、[Save]をクリックします。
4. [Create New Chromosome]をクリックします。

   下記のタイプから選択できます。
   - GenBank
   - GeneTab + ProteinSeq
5. [参照]をクリックしてファイルをアップロードします。

解析†

Mapping to default ortholog group/Genomaple alnalysis†

実行†

1. MyMBGDのトップページの[Execute Analysis]をクリックします。
2. 方法を選ぶところで、「Mapping to default ortholog group/Genomaple alnalysis」を選択します。
3. 解析条件を指定して[Execute Analysis]をクリックします。

結果†

1. MyMBGDのトップページの[Display Results]をクリックします。
2. Dataで「Genomaple」を選択します。User genomeのリストのボタンよりデフォルトセットにアサインされたデータがダウンロードできます。
3. User genomeとGenomeを選択して[Show results]をクリックするとGenomapleの結果が表示されます。

Clustering (Comparison of closely related species)†

実行†

1. MyMBGDのトップページの[Execute Analysis]をクリックします。
2. 方法を選ぶところで、「Clustering (Comparison of closely related species)」を選択します。
3. 解析条件を指定して[Execute Analysis]をクリックします。
4. 結果が表示されます。

結果†

1. MyMBGDのトップページの[Display Results]をクリックします。
2. Dataで「Clustering」を選択します。 それぞれのデータがダウンロードできます。

Overview of MBGD

Introduction

• Overview
• Functions
• References

Quick Tour

• Select & View ortholog table
• Searching ortholog data
• Create ortholog table

MyMBGD

• Login/Create User
• MyMBGD top page
• Import Genome Data
• Genome Annotation by Ortholog Group Assignment
• Ortholog Clustering
• Result Manager
• Genomaple